Molti lavori della Cooperativa in questi anni hanno trovato un ulteriore sviluppo in importanti pubblicazioni scientifiche spesso realizzate in stretta collaborazione con i funzionari delle soprintendenze archeologiche.
1998
F. Bianchi, Frammento di lastra di fregio architrave.
I.Toffoletti, Frammenti di intonaco dipinto.
In Adriano ed il suo Mausoleo, studi, indagini ed interpretazioni (catalogo della mostra) Roma 1998.
2000
S. Fontana , Un immondezzaio di VI secolo da Meninx: la fine della produzione di porpora e la cultura materiale a Gerba nella prima età bizantina.
In L'Africa romana, Atti del XIII convegno di studio (Djerba 1998).
P.Campagna, F. Del Vecchio, Sondaggi archeologici eseguiti negli ipogei nell’anno 1998/99.
In Sotterranei del Colosseo. Ricerca preliminare al progetto di ricostruzione del piano dell’arena, in R. Mitteilungen, 107.
H.Patterson, F. Di Gennaro, H.Di Giuseppe, S.Fontana, V.Gaffney, A.Harrison, S.J Keay, M. Millet, M.Rendeli, P.Roberts, S.Stoddart, R.Witcher, The Tiber Valley project: the Tiber and Rome through two millennia, in Antiquity 74.
2001
I. de Luca, F. Del Vecchio, un deposito di fine VII - inizi VIII secolo dal Foro di Nerva.
I. de Luca, , F. Del Vecchio La domus del Foro di Nerva.
S. Fontana. M. Munzi, Palatino, Domus Tiberiana, Scavi nel settore nord orientale.
S. Fontana. M. Munzi, Un deposito di VII secolo dall'Aventino.
In M. S. Arena, P. Delogu, L. Paroli, M. Ricci, L. Saguì, L. Venditelli (a cura di), Roma dall'antichità al medioevo, Archeologia e Storia nel Museo Nazionale della Crypta Balbi, Roma .
2002
E.Brienza, P. Campagna, A. Delfino, L.De Michelis, S. Fontana, S.Musco, R.Sandri Rinvenimenti archeologici 1997-2002 nel Municipio VIII.
F.Felici, M.Munzi, S.Musco, Municipio VIII, Acquedotto Alessandrino nuovi dati topografici.
I.de Luca, F. Del Vecchio, Roma. Anfiteatro Flavio. Depositi altomedievali indisturbati al I ordine”
In E. De Minicis (a cura di), Le ceramiche di Roma e del Lazio in età medievale e moderna, Atti del IV Convegno di Studi, (Viterbo - 1998).
2003
A.Bousquet, H.Di Giuseppe, F.Felici, S.Fontana, H.Patterson, , R.Witcher, S.Zampini, Le produzioni ceramiche nella media Valle del Tevere tra l’età repubblicana e tardoantica.
In Rei Cretariae Romanae Fautores 38 .
E.Brienza, P. Campagna, A. Delfino, L.De Michelis, S. Fontana, S.Musco, R.Sandri Rinvenimenti archeologici 1997-2002 nel Municipio VIII.
F.Felici, M.Munzi, S.Musco, Municipio VIII, Acquedotto Alessandrino nuovi dati topografici.
F.Bianchi, F.Felici, S.Fontana, E. Stanco, Fiano Romano, Un’area funeraria della prima età imperiale in località Palombaro.
In Bullettino Comunale 2003.
E. Cirelli, Medieval Pottery
S. Fontana, Il deposito di Forum Cistern; Le anfore della casa di Diana.
In E. Fentress (a cura di), An Intermittent Town. Excavations at Cosa 1991-1997, Chicago.
F.Felici, C.Pischedda, Provincia di Roma, Fiano Romano Loc. Belvedere, In Archeologia Postmedievale VII, 2003.
2004
Patterson, H., di Gennaro, F., Di Giuseppe, H., Fontana, S., Rendeli, M., Sansoni, M., Schiappelli, A. and Witcher, R., The re-evaluation of the South Etruria Surey: the first results from Veii in H. Patterson (a cura di) Bridiging the Tiber. Approches to regional archeology in the middle Tiber valley
H. Patterson, A.Bousquet, S.Fontana, S.Zampini, Late Roman common wares and amphorae in the middle Tiber valley, the preliminary results of the Tiber Valley Project.
In 1r Congrés Internacional sobre ceràmiques comunes, de cuina i àmfores de l’Antiguitat Tardana a la Mediterrània: Arqueologia i Arqueometria (Barcelona, 14-16 de març de 2002), BAR.
V.Beolchini, I. de Luca, S. Fontana, M.Munzi, Un contesto di VII secolo dall’ Aventino.
I. de Luca, … foro di Nerva…..
S. Fontana, M.Munzi, Domus Tiberiana:Contesti tardoantichi dal settore nord-orientale.
In L.Paroli, L.Vendittelli (a cura di) Roma dall’Antichità al Medioevo, II, Contesti tardoantichi e altomedievali.
2005
S. Keay, M. Millet, S. Paroli, K. Strutt (a cura di), Portus an archeological survey of the port of imperial Rome, London
2006
Contributi al volume Roma, memorie dal sottosuolo. Ritrovamenti archeologici 1980/2006, (a cura di M. A. Tomei)Roma 2006:
D. Mancini, schede dei materiali in “Metro C. Centro storico. Indagini preliminari di prima fase”.
D. Mancini, via Tiberina, Km 1,00 (Municipio XX): Via Tiberina Antica e Necropoli
D. Mancini-M. Ferrari schede dei materiali in “Ritrovamenti archeologici lungo la via portuense”
S.Francini “Area ex-Mira Lanza via L.Pierantoni (Municipio XV) Necropoli”
In corso di stampa
E. Cirelli, S. Fontana, La ceramica di età romana , medievale e moderna.
In A. Drine, E. Fentress, R. Holod (a cura di), The Jerba Project: Sites, Stratigraphy and Materials.